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En el edificio de investigación del Jardín Botánico, inaugurado en el año 2000, se ubican los los grupos de investigación del Instituto Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva (ICBiBE) de la Universidad de Valencia dedicadas al estudio de la biología de la conservación vegetal y de la biodiversidad y la evolución de las plantas. De este modo los grupos de investigación del Jardín estudian el paisaje y los organismos vegetales que lo forman, sus estructuras anatómicas y morfología, su distribución y biogeografía, y sus características moleculares y su genoma, sus relaciones filogenéticas.
Todos estos puntos de vista tienen como finalidad obtener datos y aunarlos para ofrecer soluciones conjuntas a la problemática de la conservación de los recursos fitogenéticos.
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