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Un herbario es una colección de plantas secas debidamente preparadas para garantizar su conservación de manera indefinida. Sobre el herbario se basa una parte importante de la investigación botánica, sobretodo en taxonomía, aunque también es útil para estudios florísticos, biogeográficos e incluso moleculares. El herbario es testimonio de las citas de plantas, de las descripciones y de los materiales utilizados para proponerlas. El tipo de una planta (el material sobre el que se basa un nombre nuevo) es, en la mayoría de los casos, una planta seca, depositada y conservada en un herbario público.
El herbario de la Universidad de Valencia, depositado en el edificio de investigación del Jardín Botánico, es el resultado de la unión de los antiguos herbarios de las Facultades de Ciencias Biológicas y de Farmacia, y el del propio del Jardín. Ocupa unas instalaciones adecuadas que garantizan la conservación y facilitan la consulta de los investigadores. Los pliegos se guardan en armarios compactos con una capacidad para unos 300.000 pliegos. Al reunirse los herbarios se ha creado uno de los más importantes de España, con más de 200.000 pliegos. El nuevo herbario contiene una buena representación de la flora de la mitad oriental de la Península Ibérica.
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